Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClasrpQ8CFC7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClasrpQ8CFC7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ClasrpQ8CFC7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ClasrpQ8CFC7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ClasrpQ8CFC7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ClasrpQ8CFC7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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