Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm9955Q8CEJ8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm9955Q8CEJ8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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