Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms