Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc178Q8CDV0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms