Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Lrrc9Q8CDN9 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Lrrc9Q8CDN9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Lrrc9Q8CDN9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Lrrc9Q8CDN9 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Lrrc9Q8CDN9 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Lrrc9Q8CDN9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Lrrc9Q8CDN9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Lrrc9Q8CDN9 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Lrrc9Q8CDN9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lrrc9Q8CDN9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Lrrc9Q8CDN9 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Lrrc9Q8CDN9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc9Q8CDN9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Lrrc9Q8CDN9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Lrrc9Q8CDN9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc9Q8CDN9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc9Q8CDN9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc9Q8CDN9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc9Q8CDN9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc9Q8CDN9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Lrrc9Q8CDN9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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