Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Lrif1Q8CDD9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Lrif1Q8CDD9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Lrif1Q8CDD9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Lrif1Q8CDD9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Lrif1Q8CDD9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Lrif1Q8CDD9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Lrif1Q8CDD9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Lrif1Q8CDD9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Lrif1Q8CDD9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Lrif1Q8CDD9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Lrif1Q8CDD9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Lrif1Q8CDD9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrif1Q8CDD9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrif1Q8CDD9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrif1Q8CDD9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrif1Q8CDD9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms