Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Nhlrc3Q8CCH2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Nhlrc3Q8CCH2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Nhlrc3Q8CCH2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Nhlrc3Q8CCH2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Nhlrc3Q8CCH2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nhlrc3Q8CCH2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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