Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip1Q8CBD1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms