Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc187Q8C5V8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc187Q8C5V8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc187Q8C5V8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc187Q8C5V8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc187Q8C5V8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc187Q8C5V8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc187Q8C5V8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc187Q8C5V8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc187Q8C5V8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc187Q8C5V8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc187Q8C5V8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc187Q8C5V8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms