Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ccdc113Q8C5T8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ccdc113Q8C5T8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ccdc113Q8C5T8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ccdc113Q8C5T8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Ccdc113Q8C5T8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Ccdc113Q8C5T8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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