Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfrp1Q8C4U3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms