Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms