Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Atg16l1Q8C0J2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Atg16l1Q8C0J2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Atg16l1Q8C0J2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Atg16l1Q8C0J2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Atg16l1Q8C0J2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Atg16l1Q8C0J2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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