Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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FarsaQ8C0C7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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FarsaQ8C0C7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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FarsaQ8C0C7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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FarsaQ8C0C7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms