Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snx16Q8C080 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snx16Q8C080 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snx16Q8C080 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snx16Q8C080 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Snx16Q8C080 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Snx16Q8C080 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Snx16Q8C080 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx16Q8C080 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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