Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Mir124-2hg-204ENSMUST00000188983 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Trim35Q8C006 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm10530-201ENSMUST00000097514 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Cntnap2-201ENSMUST00000060839 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim35Q8C006 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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