Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 3,748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vps13cQ8BX70 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vps13cQ8BX70 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vps13cQ8BX70 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vps13cQ8BX70 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vps13cQ8BX70 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vps13cQ8BX70 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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