Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ctdsp2Q8BX07 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ctdsp2Q8BX07 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ctdsp2Q8BX07 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ctdsp2Q8BX07 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ctdsp2Q8BX07 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ctdsp2Q8BX07 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdsp2Q8BX07 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ctdsp2Q8BX07 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ctdsp2Q8BX07 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ctdsp2Q8BX07 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ctdsp2Q8BX07 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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