Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmod1Q8BVA4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod1Q8BVA4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms