Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTW9

Pak4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak4Q8BTW9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pak4Q8BTW9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms