Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bicd1Q8BR07 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bicd1Q8BR07 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms