Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Gga3Q8BMI3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gga3Q8BMI3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gga3Q8BMI3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Gga3Q8BMI3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Gga3Q8BMI3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Gga3Q8BMI3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gga3Q8BMI3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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