Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Grik4Q8BMF5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms