Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rufy1Q8BIJ7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms