Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpped1Q8BFS6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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