Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc50Q810U5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ccdc50Q810U5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ccdc50Q810U5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ccdc50Q810U5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc50Q810U5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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