Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y73

UPF0722 protein C11orf88 homolog, mousemouse

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80Y73 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80Y73 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80Y73 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80Y73 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80Y73 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q80Y73 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q80Y73 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q80Y73 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q80Y73 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms