Protein–RNA interactions for Protein: Q80X53

Ccdc116, Coiled-coil domain-containing protein 116, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc116Q80X53 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ccdc116Q80X53 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc116Q80X53 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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