Protein–RNA interactions for Protein: Q80WV7

Srrm3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm3Q80WV7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Srrm3Q80WV7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srrm3Q80WV7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms