Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC30.57■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
NischQ80TM9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NischQ80TM9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms