Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ClmQ7TSN2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms