Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctdp1Q7TSG2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdp1Q7TSG2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms