Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms