Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmc8Q7TN58 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms