Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl2Q78Y63 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcl2Q78Y63 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms