Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms