Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cnot1Q6ZQ08 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms