Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gja6Q6S5G4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms