Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d2Q6PHS9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms