Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms