Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms