Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms