Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD21

Shb, SH2 domain-containing adapter protein B, mousemouse

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Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShbQ6PD21 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ShbQ6PD21 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms