Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrp12Q6P5B0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp12Q6P5B0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms