Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms