Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4Q6P1D7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slx4Q6P1D7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms