Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms