Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpbp1Q6NXH3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms