Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sohlh1Q6IUP1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sohlh1Q6IUP1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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