Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Carmil1Q6EDY6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil1Q6EDY6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms